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vmd 做膜 阅读全文
用vmd做膜可以之间用扩展进行,也可以用命令进行,比如我用命令 membrane -l POPE -x 46 -y 46 -o membrane -top c36 这里……
基本步骤: 用vmd的扩展工具新建膜(支持POPC/POPE),设置大小,然后输入膜的名称(membrane)。 把蛋白质文件(PDB)拉……
VMD学习记录 阅读全文
VMD是可视化常用的工具。 对盒子的操作: 1.打开vmd的安装目录; 2.找到vmd.rc文件,在文件中添加一行“source vmd_dra……
VMD的console是十分强大的,也提供了很多内置命令,这里把当年研究VMD内置命令的笔记的一小部分发上来。和user guide有相似之处,但是我都尽量写成例子的形式来说明,绝大部分都是亲自试……