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VMD学习记录

作者:小宝 2017-03-26 12:03:07

VMD是可视化常用的工具。

对盒子的操作:

1.打开vmd的安装目录;
2.找到vmd.rc文件,在文件中添加一行“source vmd_draw_unitcell.tcl”;(C盘的话有可能不能写入,最好复制到桌面,修改完直接粘贴到文件路径下覆盖即可)
3.设置盒子参数,如边长为60,60,60 则在命令窗口输入“molinfo top set { a b c} {60 60 60}”
4.显示盒子:输入“pbc box -on”

5.若盒子的中心在远点,则输入“pbc box -on -center origin”


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