vmd 做膜

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作者：briskLan 2019-05-20

vmd 做膜

作者：小宝 2017-04-17 10:04:15

用vmd做膜可以之间用扩展进行，也可以用命令进行，比如我用命令
```
 membrane -l POPE -x 46 -y 46 -o membrane -top c36
```
这里用了POPE脂质，x和y的长度为46，输出膜的名字是membrane（默认也是这个），用的是c36这个top文件
大概一会就生成膜了。
这个是使用说明：

Usage: membrane -l <lipid> -x <xsize> -y <ysize> {-o <prefix>} {-top <topology>}
  <lipid> is lipid name (POPC or POPE; others as added)
  <xsize> and <ysize> are membrane sizes in X and Y (Angstroms)
  <prefix> is optional output file prefix (default "membrane")
  <topology> is optional and specifies lipid CHARMM topology ("c27" or "c36", default c27)